云南黄金集团高度重视科技工作，始终贯彻“科学技术是第一生产力”的重要思想、方针、政策，推动科技创新为核心的全面创新，深化体制、机制改革，调动全体员工特别是科技人员的积极性和创造性，实现公司高质量跨越式发展。
集团科技创新工作依托云南省企业技术中心、高新技术企业、云南省创新性企业试点和院士专家工作站等综合研发平台开展，与国内知名高校、科研院所进行产学研用结合，不断提升自主创新能力和科技研发能力。
集团着力培育核心竞争优势，积极承担国家和省部级重大科研项目，三江特提斯复合造山成矿作用与找矿突破、西南三江南段新生代金成矿系统、微细粒金银铁难处理多金属氧化矿冶选、微细粒复杂难选金矿精细化浮选、低品位贵金属共伴生矿综合回收、炭浆尾液深度净化、高温高压无氰解吸电积、成品金锭电气自动控制浇铸等技术成果达到行业先进水平。
2001年公司成立以来，集团获得国家科技进步二等奖1项，省部级科技奖20余项。拥有有效专利98项，其中发明9项、实用新型76项、外观设计13项；软件著作权3项；注册商标4个。
集团坚持优先推进地质勘探和资源开发工作，依托技术优势及专业积淀，探获多处大型-超大型矿床。集团与中国地质大学(北京)等单位联合完成的“三江特提斯复合造山成矿作用与找矿突破”项目荣获国家科技进步二等奖。三江特提斯是全球最复杂的造山带和中国最重要的有色-贵金属富集区之一，然而对主导其大型-超大型矿床形成的复合成矿作用仍缺乏理论与技术支撑。依托国家973计划项目和科技支撑计划课题等，项目组历经十年产学研用协同攻关，形成了一套全新的复合成矿系统理论，直接指导发现评价了三条巨型多金属矿带和大型-超大型矿床10余处及中-小型矿床数十处，增加了我国部分紧缺矿产资源储备，综合效益显著。
集团与广东省资源综合利用研究所联合研发的“微细粒金银铁难处理多金属氧化矿冶选联合关键技术及产业化”项目，通过“控氰抑铜富氧浸出-差异化优先浸吸-脱泥梯级磁选”整体技术的研发应用，攻克了北衙金矿含金、银、铁多金属氧化矿资源因矿泥结合铜含量高、银与锰铁共生率高、有价矿物嵌布粒度微细而难以高效综合利用的难题，获得了新技术，提高了难选冶金矿综合利用水平。成果应用后，金浸出率达94.80%，银浸出率达36.16%，铁回收率达55.54%，与原工艺流程相比，金浸出率提高了12.16%，银浸出率提高了15.14%，总铁回收率提高了18.44%。
集团与北京矿冶研究总院联合研发的“微细粒复杂难选金矿高效回收精细化浮选新技术及工业应用”项目，创造性提出了“分段分流分速等性浮选”新工艺，结合高效解离技术及高效捕收剂应用技术研究，实现了金回收率的大幅提高。金平长安金矿金回收率从2009年的71.13%提高到90.07%。
集团与长春黄金研究院联合研发的“炭浆尾液深度净化与综合利用工程化技术及装备研究”项目， 针对炭浆尾液中含氰化物、硫氰酸盐、重金属和氨氮等污染物，研发了臭氧-因科复合氧化、强化混凝与重金属稳定化、高级催化深度氧化和新型曝气生物深度氧化等创新技术及配套装备。该技术可选择性去除硫氰酸盐，提高氧利用率，节省臭氧用量；研制的螯合剂和混凝剂，强化了混凝-共沉淀工序，实现了沉淀物的稳定化；可对氰化物和重金属塔内深度处理，并回收了贵金属；筛选、培育了高效亚硝化菌和硝化菌种，对氨氮进行深度处理，不产生剩余污泥，无需建设剩余污泥处理设施。废水经深度处理后，总氰化物含量低于0.05mg/l，氨氮含量低于1mg/l，其他特征污染物达到《地表水环境质量标准》ⅲ类水质标准。研究成果于2012年7月以来在鹤庆北衙矿业有限公司实现工程化应用，废水处理规模3000m3/d。生产证明，工艺运行稳定可靠，可提高企业含氰废水的突发环境事故风险防范能力，经济效益、环境效益和社会效益显著，具有示范作用。
集团下属滇金公司自主研发的“氯离子识别返回再生环保黄金提纯技术”具有无氮氧化物、硫化物气体产生，无高氯、高钠、重金属废水排放，无工业盐固体废物形成，以及低能耗、高效、环保、流程短、自动化程度高的优点，是一种高效节能新工艺，技术及装备居行业先进水平。
科技创新，为云南黄金集团实现“技术先进、指标优良、绿色环保、文明和谐、运转高效、管理科学”的发展目标提供了强有力的技术支撑和保障，不断提升了集团矿产资源开发利用水平。